Informacja

Co to jest komórka startowa?

Co to jest komórka startowa?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Czytam artykuł Cooperative Subnetworks of Molecularly Related Interneurons in Mouse Neocortex i pojawia się tam termin „komórka startowa” (strona 6):

W ten sposób uzyskano skrawki tkanek, w których SOM lub VIP ogniwa startowe niosą zarówno GFP zlokalizowane w jądrze, jak i cytoplazmatyczne mCherry

Czy ktoś wie co to jest ogniwo startowe? (Nie mogłem znaleźć tego w sieci)


Fajne pytanie - ta terminologia nie odnosi się do specjalnego typu komórki czy czegokolwiek, ale do specyfiki techniki, której używają.

Znakują podzbiór komórek wirusem wścieklizny; wścieklizna następnie wędruje wstecznie do komórek presynaptycznych i również je oznacza.

„Komórki startowe” to komórki początkowo zakażone, od których „rozpoczyna się” śledzenie. To odniesienie bardziej wyraźnie określa tę terminologię i obszernie mówi o technice, zdecydowanie polecam ją, aby pomóc zrozumieć artykuł, który czytasz.


Zwierzęta to królestwo żywych istot. Poznaj tę niesamowitą grupę organizmów.

Rośliny to królestwo żywych istot, które są w stanie produkować żywność przy użyciu energii słonecznej.

Biologia to ogromny obszar badań. Dowiedz się o różnych dziedzinach biologii.

Nasza genialnie prosta książka przeprowadzi Cię przez podstawy biologii w sposób łatwy do zrozumienia i bez trudnego naukowego żargonu. Łatwa i przyjemna do czytania książka wprowadza takie tematy, jak genetyka, komórki, ewolucja, podstawowa biochemia, szerokie kategorie organizmów, roślin, zwierząt i taksonomia.

Dostępne również w Amazon, Book Depository i wszystkich dobrych księgarniach.

BEZPŁATNY 6-tygodniowy kurs

Wprowadź swoje dane, aby uzyskać dostęp do naszego BEZPŁATNEGO 6-tygodniowego kursu e-mailowego dotyczącego biologii.

Dowiedz się o zwierzętach, roślinach, ewolucji, drzewie życia, ekologii, komórkach, genetyce, dziedzinach biologii i nie tylko.

Powodzenie! Na podany przed chwilą adres e-mail został wysłany e-mail z potwierdzeniem. Sprawdź swoje e-maile i upewnij się, że klikniesz link, aby rozpocząć nasz 6-tygodniowy kurs.

Biologia podstawowa: wprowadzenie

Dostępne również w Amazon, Book Depository i wszystkich innych dobrych księgarniach.


Zwierzęta to królestwo żywych istot. Poznaj tę niesamowitą grupę organizmów.

Rośliny to królestwo żywych istot, które są w stanie produkować żywność przy użyciu energii słonecznej.

Biologia to ogromny obszar badań. Dowiedz się o różnych dziedzinach biologii.

Nasza genialnie prosta książka przeprowadzi Cię przez podstawy biologii w sposób łatwy do zrozumienia i bez trudnego naukowego żargonu. Łatwa i przyjemna do czytania książka wprowadza takie tematy, jak genetyka, komórki, ewolucja, podstawowa biochemia, szerokie kategorie organizmów, roślin, zwierząt i taksonomia.

Dostępne również w Amazon, Book Depository i wszystkich dobrych księgarniach.

BEZPŁATNY 6-tygodniowy kurs

Wprowadź swoje dane, aby uzyskać dostęp do naszego BEZPŁATNEGO 6-tygodniowego kursu e-mail z wprowadzeniem do biologii.

Dowiedz się o zwierzętach, roślinach, ewolucji, drzewie życia, ekologii, komórkach, genetyce, dziedzinach biologii i nie tylko.

Powodzenie! Na podany przed chwilą adres e-mail został wysłany e-mail z potwierdzeniem. Sprawdź swoje e-maile i upewnij się, że klikniesz link, aby rozpocząć nasz 6-tygodniowy kurs.

Biologia podstawowa: wprowadzenie

Dostępne również w Amazon, Book Depository i wszystkich innych dobrych księgarniach.


PRZYJMOWANIE NIEPEWNOŚCI I STRACHU TO POTĘŻNA STRATEGIA SUKCESU

Jako biolog eksperymentalny szybko nauczyłem się, że chociaż wynik naukowy może być przewidywalny na podstawie hipotezy i eksperymentu zaprojektowanego do jego przetestowania, nieprzewidywalne wyniki są powszechne, a niektóre z najbardziej interesujących wyników powstają jako funkcja nieprzewidywalności. Tak więc kariera może skorzystać na nieprzewidywalności. Pod moim parasolem plażowym nie miałem pojęcia, że ​​kiedyś moja przyszłość wypełni się oszałamiającą liczbą doświadczeń rządu federalnego, bez których nie wiedziałbym dzisiaj, jak ustalane są priorytety dla amerykańskiego przedsiębiorstwa badawczego ani jak to jest zorganizowane i finansowane. Na przykład, kiedy po raz pierwszy przyjechałem do Waszyngtonu, dowiedziałem się, że każdego roku OSTP i Biuro Zarządzania i Budżetu (OMB) publikują notatkę dla agencji federalnych finansujących naukę i technologię (S&T), która opisuje priorytety administracji w zakresie następny budżet federalny, zasadniczo „mapa drogowa”, na którą za dwa lata pójdzie finansowanie nauki.

Nie wiedziałem też, że zostanę głównym autorem krajowego dokumentu politycznego, National Bioeconomy Blueprint 2012 (NBB Maxon, 2012), którego zapowiedzią była notatka dotycząca priorytetów OSTP i OMB S&T na rok 2012 (Orszag i Holdren, 2010). Dokument mający kształtować przyszłość amerykańskiej polityki biotechnologicznej był onieśmielający. Jednocześnie wiedziałem, że moje kotlety naukowe pomogą mi zdefiniować podstawowe pytania i opracować rozsądne strategie. Podczas opracowywania NBB reagowałem również na pilne wydarzenia, takie jak wyciek ropy Deepwater Horizon, trzęsienie ziemi i tsunami w Fukushimie oraz szereg innych pilnych działań OSTP (Biuro Sekretarza Prasowego, Biały Dom, 2016), które służyły spraw, aby każdy dzień był nieprzewidywalny i ekscytujący.

W końcu ogarnęła mnie niepewność i obawa, że ​​nie jestem doskonale przygotowana do obowiązków zawodowych, z którymi miałam niewielkie doświadczenie. Zacząłem je postrzegać jako pomoc w rozwijaniu umiejętności odporności i zaradności. Teraz, jako zastępca dyrektora laboratorium ds. nauk biologicznych w Lawrence Berkeley National Laboratory, postrzegam je jako moje główne cenne atuty, gdy pojawia się wiele konkurencyjnych priorytetów i zastraszających zadań, jak zawsze. Na przykład, kiedy po raz pierwszy zeznawałem przed Kongresem (Rysunek 1) w 2015 r. (Maxon, 2015 r.), starałem się przezwyciężyć swoje obawy, wyobrażając sobie, że doświadczenie może być podobne do mojego ustnego egzaminu maturalnego. (Być może moje doświadczenie w szkole podyplomowej przygotowało mnie na więcej, niż zdawałem sobie sprawę, kiedy zaczynałem ten esej!) Moje przeszłe doświadczenia prowadziły do ​​interesujących możliwości zawodowych: do dziś moja poprzednia praca w NBB nadal owocuje zaproszeniami międzynarodowymi dla mnie, aby opisać rozwój i wyniki naszej strategii krajowej.

RYSUNEK 1: Mary Maxon, zastępca dyrektora laboratorium ds. nauk biologicznych w Lawrence Berkeley National Laboratory, dwukrotnie zeznawała przed Komisją ds. Nauki, Przestrzeni i Technologii Izby Reprezentantów USA: tutaj, 14 marca 2018 r., na sesji poświęconej czołowym światowym innowacjom w nauce z krajowych laboratoriów Wydziału Energetyki. Zdjęcie: Komitet Domowy ds. Nauki, Przestrzeni Kosmicznej i Technologii — większość.


Kopnięcie kończące i rozmiar krytyczny

Od wielu lat wiadomo, że wolno rosnące komórki mają długi G1 i tylko wtedy, gdy komórki te urosną do „krytycznego rozmiaru”, mogą przejść przez Start. W hipotezie kopnięcia kończącego wielkość krytyczna jest równoważna zmagazynowanym węglowodanom, to znaczy hipoteza przewiduje, że parametrem skorelowanym z wielkością mierzonym przez komórkę jest glikogen plus trehaloza. Kiedy zmagazynowana jest wystarczająca ilość węglowodanów do pomyślnego przejścia przez tę energochłonną i materiałochłonną część cyklu komórkowego, jest to w jakiś sposób wyczuwane (być może poprzez jakiś metabolit związany z glukozą, taki jak glukozo-6-fosforan i cykliczny szlak AMP), sygnał jest wysłana (ponownie, być może poprzez cykliczny szlak AMP), węglowodany zostają zlikwidowane, powstaje ATP i dochodzi do gwałtownego metabolizmu, syntezy nukleotydów, syntezy białek i wszystkich innych wydarzeń związanych ze Startem. Szczyt późnego G1 w ekspresji genów syntezy rybosomów i białek odnotowany przez Klevecz i inni. [6] i Tu i inni. [7] tłumaczy się potrzebą gwałtownej syntezy białek. Co ciekawe, większość mutacji wpływających na krytyczny rozmiar komórki albo wpływa na syntezę cyklin G1 (na przykład CLN3-1, whi3 oraz whi5) lub są związane (choć nie w rzeczywistości) cyklicznym szlakiem AMP (sch9 oraz sfp1) [24]. Oscylacje w innych metabolitach i zestawach genów można wyjaśnić jako dalsze skutki oscylacji zmagazynowanych węglowodanów i gwałtownego metabolizmu.

Hipoteza kopnięcia kończącego może wyjaśniać tylko krytyczny rozmiar i Start w wolno rosnących komórkach. Komórki szybko rosnące na dużej ilości glukozy mają niewiele lub nie mają zmagazynowanych węglowodanów, aw każdym razie nie mają potrzeby gwałtownego metabolizmu, a hipoteza kopnięcia końcowego jest nieistotna dla takich komórek. Istnieją jednak również dowody na to, że komórki wykorzystują wiele mechanizmów kontrolowania czasu Startu [23], a mechanizmy stosowane w komórkach szybko rosnących mogą być zupełnie inne niż te w komórkach wolno rosnących [25].

Oczywiste jest, że drożdże o ograniczonej zawartości glukozy przechodzą oscylację metaboliczną nałożoną na oscylację cyklu komórkowego. To, czy ta oscylacja metaboliczna służy przede wszystkim czasowemu podziałowi różnych procesów metabolicznych, czy przede wszystkim zarządzaniu Startem w trudnych warunkach, czy też obie hipotezy są prawdziwe, pozostaje do ustalenia. Obiecującą drogą do rozróżnienia hipotez jest badanie mutantów, które nie magazynują glikogenu ani trehalozy [2, 26]. Takie mutanty żyją, ale z nieprawidłowymi cyklami komórkowymi. Obecnie analiza fenotypowa nie jest wystarczająco szczegółowa, aby rozróżnić te dwie hipotezy, ale w zasadzie mutanty pozbawione węglowodanów magazynujących powinny pozwolić na kilka interesujących eksperymentów.


Bibliografia

Wagner A, Regev A, Yosef N. Ujawnianie wektorów tożsamości komórkowej za pomocą genomiki pojedynczej komórki. Nat Biotechnol. 2016 34(11): 1145–60. https://doi.org/10.1038/nbt.3711.

Trapnell C, Cacchiarelli D, Grimsby J, Pokharel P, Li S, Morse M, Lennon NJ, Livak KJ, Mikkelsen T. S, Rinn JL. Dynamikę i regulatory decyzji o losie komórki ujawnia pseudoczasowe uporządkowanie pojedynczych komórek. Nat Biotechnol. 2014 32(4):381–6. https://doi.org/10.1038/nbt.2859.

Bendall SC, Davis KL, Amir E-aD, Tadmor MD, Simonds EF, Chen TJ, Shenfeld DK, Nolan GP, ​​Pe’er D. Wykrywanie trajektorii pojedynczych komórek odkrywa progresję i koordynację regulacyjną w rozwoju ludzkich komórek B. Komórka. 2014 157(3):714–25. https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.04.005.

Saelens W, Cannoodt R, Todorov H, Saeys Y. Porównanie metod wnioskowania o trajektorii pojedynczej komórki: w kierunku bardziej dokładnych i niezawodnych narzędzi. bioRxiv. 2018:276907. https://doi.org/10.1101/276907.

Qiu X, Hill A, Packer J, Lin D, Ma YA, Trapnell C. Kwantyfikacja mRNA pojedynczej komórki i analiza różnicowa ze spisem. Metody Nat. 2017 14:309–15. https://doi.org/10.1038/nmeth.4150.

Setty M, Tadmor MD, Reich-Zeliger S, Angel O, Salame TM, Kathail P, Choi K, Bendall S, Friedman N, Pe’er D. Wishbone identyfikuje rozwidlające się trajektorie rozwojowe na podstawie danych jednokomórkowych. Nat Biotechnol. 2016 34:637–45. https://doi.org/10.1038/nbt.3569.

Haghverdi L, Büttner M, Wolf FA, Buettner F, Theis FJ. Pseudoczas dyfuzji solidnie rekonstruuje rozgałęzione linie komórkowe. Metody Nat. 2016 13:845–8. https://doi.org/10.1038/nmeth.3971.

Street K, Risso D, Fletcher RB, Das D, Ngai J, Yosef N, Purdom E, Dudoit S. Slingshot: pochodzenie komórek i wnioskowanie pseudoczasowe dla transkryptomiki pojedynczej komórki. Genomika BMC. 2018 19:477. https://doi.org/10.1186/s12864-018-4772-0.

Rizvi AH, Camara PG, Kandror EK, Roberts TJ, Schieren I, Maniatis T, Rabadan R. Analiza topologiczna rna-seq pojedynczej komórki ujawnia wgląd w różnicowanie i rozwój komórek. Nat Biotechnol. 2017 35(6):551–60. https://doi.org/10.1038/nbt.3854.

Qiu P, Simonds EF, Bendall SC, Gibbs KD, Bruggner RV, Linderman MD, Sachs K, Nolan GP, ​​Plevritis SK. Wyodrębnianie hierarchii komórkowej z wysokowymiarowych danych cytometrycznych za pomocą łopaty. Biotechnologia Nat. 2011 29(10):886–91. https://doi.org/10.1038/nbt.1991.

Giecold G, Marco E, Garcia SP, Trippa L, Yuan GC. Solidna rekonstrukcja linii z wielowymiarowych danych jednokomórkowych. Kwasy nukleinowe Res. 2016 44(14):122. https://doi.org/10.1093/nar/gkw452.

Grün D, Muraro MJ, Boisset JC, Wiebrands K, Lyubimova A, Dharmadhikari G, van den Born M, van Es J., Jansen E, Clevers H i in. Przewidywanie de novo tożsamości komórek macierzystych na podstawie danych z transkryptomu pojedynczej komórki. Komórka Komórka Macierzysta. 2016 19(2):266–77. https://doi.org/10.1016/j.stem.2016.05.010.

Plass M, Solana J, Wolf FA, Ayoub S, Misios A, Glažar P, Obermayer B, Theis FJ, Kocks C, Rajewsky N. Atlas typu komórek i drzewo genealogiczne całego złożonego zwierzęcia za pomocą transkryptomiki pojedynczej komórki. Nauki ścisłe. 2018 360(6391):1723. https://doi.org/10.1126/science.aaq1723.

Hu Y, Shi L. Wizualizacja dużych wykresów. Wiley Interdiscip Rev Comput Stat. 2015 7(2):115–36. https://doi.org/10.1002/wics.1343.

van der Maaten L, Hinton G. Wizualizacja danych przy użyciu t-sne. J Mach Learn Res. 2008 9 (listopad): 2579–605.

Islam S, Kjallquist U, Moliner A, Zajac P, Fan JB, Lonnerberg P, Linnarsson S. Charakterystyka jednokomórkowego krajobrazu transkrypcyjnego za pomocą wysoce multipleksowego rna-seq. Genom Res. 2011 21(7):1160-7. https://doi.org/10.1101/gr.110882.110.

Levine JH, Simonds EF, Bendall SC, Davis KL, Amir E-aD, Tadmor MD, Litvin O, Fienberg HG, Jager A, Zunder ER, Finck R, Gedman AL, Radtke I, Downing JR, Pe'er D, Nolan lekarz ogólny. Oparta na danych analiza fenotypowa AML ujawnia komórki podobne do komórek progenitorowych, które korelują z rokowaniem. Komórka. 2015 162(1):184–97. https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.05.047.

Blondel VD, Guillaume JL, Lambiotte R, Lefebvre E. Szybkie rozwijanie społeczności w dużych sieciach. J Stat Mech. 2008 2008:10008. https://doi.org/10.1088/1742-5468/2008/10/P10008. 0803.0476v2.

Xu C, Su Z. Identyfikacja typów komórek z transkryptomów jednokomórkowych przy użyciu nowej metody grupowania. Bioinformatyka. 2015 31(12):1974–80. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv088.

Newman MEJ. Modułowość i struktura społeczności w sieciach. Proc Natl Acad Sci. 2007 103(23):8577–582. https://doi.org/10.1073/pnas.0601602103.

Singh G, Memoli F, Carlsson GE. Metody topologiczne do analizy zbiorów danych wielkowymiarowych i rozpoznawania obiektów 3d. W: Sympozjum Eurographics na temat grafiki opartej na punktach: 2007. s. 91-100. http://cs233.stanford.edu/ReferencedPapers/mapperPBG.pdf.

McInnes L, Healy J. Umap: Jednolite przybliżenie rozmaitości i rzutowanie dla redukcji wymiarów. 2018: 1802–03426. arXiv:1802.03426.

Jacomy M, Venturini T, Heymann S, Bastian M. ForceAtlas2, algorytm ciągłego układu wykresów do wygodnej wizualizacji sieci zaprojektowany dla oprogramowania gephi. PLo JEDEN. 2014 9(6):98679. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098679.

Paul F, Arkin Y, Giladi A, Jaitin DA, Kenigsberg E, Keren-Shaul H, Winter D, Lara-Astiaso D, Gury M, Weiner A, David E, Cohen N, Lauridsen FKB, Haas S, Schlitzer A, Mildner A, Ginhoux F, Jung S, Trumpp A, Porse BT, Tanay A, Amit I. Transkrypcyjna heterogeniczność i zaangażowanie w linię u progenitorów szpiku. Komórka. 2015 163:1663–77. https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.11.013.

Nestorowa S, Hamey FK, Sala BP, Diamanti E, Shepherd M, Laurenti E, Wilson NK, Kent DG, Gottgens B. Jednokomórkowa mapa rozdzielczości różnicowania krwiotwórczych komórek macierzystych i progenitorowych myszy. Krew. 2016 128(8):20–31. https://doi.org/10.1182/blood-2016-05-716480.

Dahlin JS, Hamey FK, Pijuan-Sala B, Shepherd M, Lau WWY, Nestorowa S, Weinreb C, Wolock S, Hannah R, Diamanti E, Kent DG, Göttgens B, Wilson NK. Jednokomórkowy krajobraz hematopoetyczny rozwiązuje osiem trajektorii linii i defekty u myszy z mutacją zestawu. Krew. 2018 131:1–11. https://doi.org/10.1182/blood-2017-12-821413.

Görgens A, Ludwig AK, Möllmann M, Krawczyk A, Dürig J, Hanenberg H, Horn PA, Giebel B. Multipotentni przodkowie hematopoetyczni dzielą się asymetrycznie, tworząc przodków linii limfomieloidalnych i erytromieloidalnych. Rep. Komórek Macierzystych 2014 3:1058–72. https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2014.09.016.

Tusi BK, Wolock SL, Weinreb C, Hwang Y, Hidalgo D, Zilionis R, Waisman A, Huh JR, Klein AM, Socolovsky M. Migawki populacji przewidują wczesną hierarchię krwiotwórczą i erytroidalną. Natura. 2018 555(7694):54-60. https://doi.org/10.1038/nature25741.

La Manno G, Soldatov R, Zeisel A, Braun E, Hochgerner H, Petukhov V, Lidschreiber K, Kastriti ME, Lönnerberg P, Furlan A, et al. Prędkość RNA pojedynczych komórek. Natura. 2018 560(7719):494. https://doi.org/10.1038/s41586-018-0414-6.

Wagner DE, Weinreb C, Collins ZM, Briggs JA, Megason SG, Klein AM. Mapowanie pojedynczych komórek krajobrazów ekspresji genów i linii rodowej w zarodku danio pręgowanego. Nauki ścisłe. 2018:4362. https://doi.org/10.1126/science.aar4362.

Regev A, Teichmann SA, Lander ES, Amit I, Benoist C, Birney E, Bodenmiller B, Campbell PJ, Carninci P, Clatworthy M, Clevers H, Deplancke B, Dunham I, Eberwine J, Eils R, Enard W, Farmer A , Fugger L, Göttgens B, Hacohen N, Haniffa M, Hemberg M, Kim SK, Klenerman P, Kriegstein A, Lein E, Linnarsson S, Lundberg E, Lundeberg J, Majumder P, Marioni JC, Merad M, Mhlanga M, Nawijn M, Netea M, Nolan G, Pe'er D, Phillipakis A, Ponting CP, Quake SR, Reik W, Rozenblatt-Rosen O, Sanes JR, Satija R, Schumacher TN, Shalek AK, Shapiro E, Sharma P, Shin JW , Stegle O, Stratton MR, Stubbington MJT, Theis FJ, Uhlen M, van Oudenaarden A., Wagner A, Watt FM, Weissman JS, Wold BJ, Xavier RJ, NY. Forum naukowe: Atlas komórek ludzkich. e-życie. 2017 6:27041. https://doi.org/10.7554/elife.27041.

Eulenberg P, Köhler N, Blasi T, Filby A, Stolarz AE, Rees P, Theis FJ, Wilk FA. Rekonstrukcja cyklu komórkowego i progresji choroby za pomocą głębokiego uczenia. Społeczność Nat. 2017 8:463. https://doi.org/10.1038/s41467-017-00623-3.

Satija R, Farrell JA, Gennert D, Schier AF, Regev A. Przestrzenna rekonstrukcja danych dotyczących ekspresji genów w pojedynczej komórce. Nat Biotechnol. 2015 33:495-502. https://doi.org/10.1038/nbt.3192.

Wolf FA, Angerer P, Theis FJ. SCANPY: analiza danych dotyczących ekspresji genów w pojedynczej komórce na dużą skalę. Biol genomowy. 2018 19(1):15. https://doi.org/10.1186/s13059-017-1382-0.

Lopez R, Regier J, Cole MB, Jordan MI, Yosef N. Nat Methods. 2018 15(12):1053. https://doi.org/10.1038/s41592-018-0229-2.

Wolf FA, Hamey F, Plass M, Solana J, Dahlin JS, Göttgens B, Rajewsky N, Simon L, Theis FJ. PAGA: Abstrakcja grafów godzi grupowanie z wnioskowaniem o trajektorii za pomocą mapy z zachowaniem topologii pojedynczych komórek. Repozytorium GitHub. 2019. https://github.com/theislab/paga.


3 główne etapy translacji RNA | Komórka biologiczna

Poniższe punkty podkreślają trzy główne etapy translacji syntezy RNA i białek. Etapy to: 1. Inicjacja polipeptydu 2. Wydłużenie polipeptydu: 3. Terminacja polipeptydu.

Translacja RNA: Etap 1. Inicjacja polipeptydu:

Rybosomy istnieją jako oddzielne duże i małe podjednostki. Pierwszy etap translacji obejmuje wiązanie małej podjednostki rybosomalnej z mRNA. Translacja zwykle rozpoczyna się od sekwencji AUG, czasami GUG, która koduje metioninę i jest znana jako kodon inicjacji trans&szylacji.

Mała podjednostka wiąże się z mRNA w określonym punkcie (sekwencja Shine-Dalgarno) powyżej AUG. U eukariontów mała podjednostka rybosomalna rozpoznaje strukturę czapeczki na końcu 5′ mRNA. Następnie porusza się w dół rzeki, aż napotka pierwszy AUG. tRNA naładowane metioniną wiąże się z AUG zlokalizowanym przez małą podjednostkę rybosomalną.

Inicjacja łańcucha polipeptydowego zachodzi przy udziale czynników inicjacji, podjednostek rybosomalnych i kompleksu aminoacylo-tRNA.

Do inicjacji wymagana jest pewna liczba białek pomocniczych zwanych czynnikami inicjacji. Bakterie mają trzy, znane jako IF1, IF2 i IF3. Inicjacja rozpoczyna się od wiązania IF1 i IF3 z małą podjednostką rybosomalną. Pomaga to zapobiegać wiązaniu dużej podjednostki przed związaniem się mRNA. Następnie IF2 skompleksowany z GTP wiąże małą podjednostkę. Jego celem jest wspomaganie wiązania inicjatora tRNA.

Mała podjednostka następnie wiąże mRNA i lokalizuje kodon inicjacji AUG. Inicjatorowe tRNA naładowane metioniną wiąże się z kompleksem i uwalniany jest IF3. Następnie duża podjednostka rybosomalna wiąże się z kompleksem inicjacyjnym do funkcjonalnego rybosomu com­plete. Towarzyszy temu uwalnianie IF1 i IF2 oraz hydroliza GTP (ryc. 16.10).

Tworzenie formylo-metionylowego tRNAƒmet:

U prokariontów. metionina zawiera grupę formylową (-CHO) i stąd nazywa się ją N-formylometioniną. Inicjacja syntezy odbywa się poprzez inicjacyjne tRNA. Jest określany skrótem tRNAƒmet. Inicjacyjny tRNA lub tRNAƒmet tworzy z metioniną kompleks zwany metionylowym tRNAƒmet.

Grupa aminowa metioniny jest blokowana przez grupę formylową, tworząc N-formylometionylowy tRNAƒmet. Ta reakcja jest katalizowana przez transformylazę.

Wiązanie czynników inicjacji z 305:

Mała podjednostka rybosomalna wiąże IF1, IF3. Następnie IF2 skompleksowany z GTP wiąże małą podjednostkę.

Wiązanie 30S z mRNA:

Rybosomy są miejscami syntezy białek i są zdysocjowane na podjednostki (505 i 305). Podjednostka 305 przyłączona do kodonu AUG formy mRNA i zasłaniająca kompleks mRNA-30S. Proces wymaga współczynnika inicjacji IF3.

Wiązanie fmet-tRNAfmet z kompleksem 305-mRNA:

Fmet-tRNAfmet przyłącza się do kompleksu 30S-mRNA, tworząc kompleks inicjacyjny 305-mRNA-fmet-tRNA/met. Ta reakcja jest ułatwiona przez czynnik inicjacji IF2. IF3 jest uwalniany w tym kroku.

Stowarzyszenie podjednostek rybosomalnych:

Utworzony kompleks inicjujący łączy się następnie z podjednostką SOS w celu odtworzenia rybosomu 70S. Podczas tego procesu OTP jest konwertowane na PKB i uwalniane są współczynniki inicjacji i IF1 i IF2.

Istnieją niewielkie różnice w inicjacji łańcuchów polipeptydowych In pomiędzy prokariontami i eukariontami.

U eukariontów jest więcej czynników inicjacji. Czynnikami tymi są elF1, elF2, elF3, elF4A, elF4B, elF4C, elF4D, elF4F, elF5, elF6. ElF2, elF3, elF4A i elF4F zawierają wiele łańcuchów polipeptydowych, ale inne są prostymi polipeptydami elF2 i elF3 są analogiczne do IF2 i IF3 prokariotów.

Powstawanie kompleksu trójargumentowego:

OTP wiąże się z elF2, co zwiększa jego powinowactwo do mettRNAmet. Ten met-tRNAmet wiąże się z kompleksem elF2 – GTP tworząc potrójny kompleks, tj. met-tRNAmet-elF2-GTP. Inicjatorowe tRNA nie jest formylowane u eukariontów.

Związek Zespołu Trójczłonowego z Pododdziałem 40S:

Kompleks trójskładnikowy łączy się z podjednostką 40S, tworząc kompleks inicjacyjny 43S. Czynnik elF2 ma trzy podjednostki, a mianowicie α, β, γ. ElF2α wiąże się z GTP, elF2γ wiąże się z met-tRNA, a elF2β może być czynnikiem recyklingu.

Wiązanie mRNA z 43S Inicjacja Com­plex:

mRNA na końcu 5′ wiąże się z kompleksem inicjalizacyjnym 43S. Ta reakcja zależy od elF3, a wiązanie mRNA jest wspomagane przez elF4F, elF4B i wysokoenergetyczne wiązanie ATP.

Powiązanie z podjednostką 60S:

Po asocjacji końca S’ mRNA, com­plex inicjacyjny przesuwa się w kierunku końca 3′ w poszukiwaniu kodonu inicjacji AUG, a następnie asocjuje również z podjednostką 60S.

To połączenie podjednostki 60S z kompleksem inicjacyjnym wymaga czynnika elFS, ponieważ pomaga w uwalnianiu elF2 i elF3. elF2 jest uwalniany jako kompleks binarny, elF2-GDR Reakcja łączenia 40S-60S naprawdę zależy od elF4C, a GTP kompleksu inicjującego jest hydrolizowany, gdy rybosom SOS jest odtwarzany.

Translacja RNA: Etap 2. Wydłużenie polipeptydu:

Wydłużenie polipeptydu zostało przedstawione na Fig. 16.11.

Do elongacji potrzebnych jest wiele białek pomocniczych. U proków i szyriotów zaangażowane są dwa czynniki wydłużenia, EF-Tu i Ef-Ts. EF-Tu jest związany z wejściem tRNA do miejsca A rybosomu. Ef-Tu wiąże naładowane tRNA w połączeniu z GTP. Po wejściu do miejsca A, GTP jest hydrolizowany, a EF-Tu jest uwalniany związany z difosforanem guanozyny (GDP).

Zanim kolejny tRNA będzie mógł się związać, EF-Tu musi zostać zregenerowany za pomocą Ef-T.

Po pierwsze, EF-T wypiera GDP, wiążąc się z EF-Tu nową cząsteczką GTP, a następnie zastępuje EF-T (ryc. 16.12). U eukariontów białko com­plex o nazwie eEF-1 przenosi tRNA do miejsca A. Ponownie, reakcja jest związana z hydrolizą GTP.

Wiązanie AA-tRNA w miejscu rybosomu:

Większa podjednostka rybosomu ma dwa miejsca, do których przyłączone są dwie cząsteczki tRNA. Są to tak zwane miejsca P (miejsce peptydowe) i miejsce A (miejsce aminoacylowe). fmet-tRNAƒmet najpierw dociera do miejsca A, a następnie do miejsca P, aby udostępnić miejsce A dla następnego aminoacylo tRNA. Do przyłączenia AA-tRNA do miejsca A wymagana jest cząsteczka GTP i czynniki elongacji Ef-Tu i EF-T.

Ef-Tu tworzy trójskładnikowy kompleks z AA-tRNA i GTP (AA-tRNA-GTP-EF-Tu). Tworzenie tego kompleksu jest katalizowane przez EF-T. Te złożone depozyty AA-tRNA w miejscu A i GDP, EF-Tu są uwalniane wraz z grupą fosforanową i szyfatową.

Tworzenie wiązania peptydowego:

Jest to reakcja kata&szylityczna, podczas której tworzy się wiązanie peptydowe pomiędzy wolną grupą karboksylową (-COOH) peptydylowego tRNA w miejscu P a wolną grupą aminową (-NH2) obecna z aminoacylo-tRNA w miejscu A.

Enzymem biorącym udział w tej reakcji jest transferaza peptydylowa stanowiąca wewnętrzną część podjednostki rybosomalnej SOS. Po utworzeniu wiązania peptydowego, tRNA w miejscu P ulega deacylowaniu, a tRNA w miejscu A przenosi polipeptydy.

Translokacja peptydylowego tRNA z miejsca A do P:

Peptydylowe tRNA obecne w miejscu A jest następnie translokowane do miejsca P.

Istnieją dwa modele translokacji peptydylowego tRNA z miejsca A do miejsca P:

(i) Zgodnie z modelem dwóch miejsc (A, P), deacylowane tRNA jest uwalniane z miejsca P i za pomocą jednej cząsteczki GTP i czynnika elongacji EF-G, pep&szytydylowe tRNA jest translokowane z A do Strona P. Czynnik elongacyjny EF-G, wiążący się z rybosomem, jest uwalniany w wyniku hydrolizy GTP.

(ii) Zgodnie z modelem trzech miejsc (A, P, E), początkowo koniec aminoacylowy t-RNA związanego z miejscem A przesuwa się do miejsca P na podjednostce SOS w momencie trans&shifer peptydu, ale dopiero później podczas translokacji , koniec antykodonu tego tRNA przesuwa się z miejsca A do P na podjednostce 30S. Ten ostatni etap wymaga działania czynnika wydłużenia EF-G.

Zatem w tym modelu występuje stan pośredni, kiedy koniec antykodonu tego tRNA nadal znajduje się w miejscu A (na podjednostce SOS), podczas gdy koniec aminoacylowy zajmuje miejsce P (na podjednostce SOS). Trzecie miejsce wiązania tRNA, E, zostało również rozpoznane na podjednostce SOS, przez którą tRNA opuszcza rybosomy.

Translacja RNA: Etap 3. Zakończenie polipeptydu:

Terminacja łańcucha polipeptydowego jest spowodowana obecnością dowolnego z trzech kodonów terminacji, a mianowicie UAA, UAG i UGA.

U prokariontów kodony terminacji są rozpoznawane przez jeden z dwóch czynników uwalniania, RF1 i RF2. Spośród tych czynników uwalniania RF1 rozpoznaje UAA i UAG, a RF2 rozpoznaje i nieśmiałość UGA. Pomagają rybosomom w rozpoznaniu i zniekształceniu tych trojaczków. Trzeci czynnik uwalniania RF3 wydaje się stymulować działanie RF1 i RF2. U eukariontów istnieje tylko jeden czynnik uwalniania (eRFI).

Uwolnienie polipeptydu:

W celu uwolnienia, polipeptydylowy tRNA musi być obecny w miejscu P, a czynniki uwalniania pomagają w rozszczepieniu grup karboksylowych między polipeptydem a ostatnim tRNA niosącym ten łańcuch (ryc. 16.13). Polipeptyd zostaje w ten sposób uwolniony, a rybosom dysocjuje na 2 podjednostki za pomocą IF3.

U eukariontów istnieje tylko jeden czynnik uwalniania – eRFI. GTP wydaje się być niezbędny do związania tego czynnika z rybosomem. GTP jest odejmowane po wystąpieniu etapu zakończenia, co może być warunkiem wstępnym uwolnienia RF1 z rybo&szysomu.

Modyfikacja uwolnionego polipeptydu:

Uwolnione polipeptydy są modyfikowane na różne sposoby. Enzym deformylaza usuwa grupę formylową pierwszego aminokwasu metioniny. Ze względu na działanie niektórych innych enzymów, egzo-aminopeptydaz, aminokwasy mogą zostać usunięte z struktury trzeciorzędowej. W ten sposób te białka z końca N lub końca C ostatecznie stają się funkcjonalnymi enzymami, końcem lub obydwoma.

Łańcuch polipeptydowy pojedynczo lub w połączeniu z innym łańcuchem również fałduje się, aby przyjąć strukturę trzeciorzędową. W ten sposób białka te ostatecznie stają się funkcjonalnymi enzymami. Cały proces translacji przedstawia skojarzenie z innymi łańcuchami również fałdami do podjęcia na ryc. 16.14.


Hodowla komórek T Jurkat - (30.11.2007 )

z jakichś powodów planujemy zacząć od komórek T Jurkat, ale nie mam doświadczenia potrzebuję podstawowych informacji:

zwolennik czy nie?
czy istnieją podlinii i które są powszechnie używane?
Czas tworzenia?
trudności w obsłudze?
inne specjalne informacje?

Nieprzylegające, są podteksty, o których wiem, ale to są transfekowane.
Czas generowania to około 24 godzin, jeśli się nie mylę i są łatwe w obsłudze.

Co musisz z nimi zrobić, czego nie możesz zrobić z innymi komórkami?

Nieprzylegające, są podteksty, o których wiem, ale to są transfekowane.
Czas generowania to około 24 godzin, jeśli się nie mylę i są łatwe w obsłudze.

Co musisz z nimi zrobić, czego nie możesz zrobić z innymi komórkami?

dzięki vairus jesteśmy zainteresowani PKCtheta, o której wiadomo, że ulega ekspresji w komórkach T PKCtheta jest rzadko wyrażana w większości innych typów komórek

jeszcze jedno pytanie: czy komórki Jurkata są onkogenne, czy tylko nieonkogenne są nieśmiertelne?

z jakichś powodów planujemy zacząć od komórek T Jurkat, ale nie mam doświadczenia potrzebuję podstawowych informacji:

zwolennik czy nie?
czy istnieją podlinii i które są powszechnie używane?
Czas tworzenia?
trudności w obsłudze?
inne specjalne informacje?

Nasza grupa od wielu lat uprawia Jurkaty. Są bardzo łatwe w utrzymaniu, jeśli warunki są utrzymywane na stałym poziomie, tj.

Korzystaj z najlepszej jakości FBS/FCS i TESTÓW SERII.
Rozpocznij komórki w kolbach do hodowli tkankowych, na przykład T75.
Nigdy nie „podzielaj nadmiernie” komórek, tj. stosunek podziału 1:10-1:20. ALE NA PIERWSZYM PODEJŚCIU, gdy dziecko dochodzi do siebie po kriokonserwacji, zastosuj podziały 1:2/1:4.
Po ich założeniu wyhoduj komórki w butelkach Techne Stirrer. pozwala to na wyhodowanie setek milionów komórek na potrzeby eksperymentów.

Nasze grupy referują artykuły:

PNAS Beltan i wsp. 19 grudnia 2000, tom 97, nr 26, s. 14602-14607

PNAS Beltran i wsp. 25 czerwca 2002 r., tom 99, nr 13, str. 8892-8897

dziekuje Rhombus, bardzo pomocna informacja zacznę jak doradzę

Czy te komórki różnią się od komórek Jurkata? Ciekawe, bo komórki Jurkata również mają te same właściwości, co powyżej.

Ja też po raz pierwszy hoduję komórki Jurkata i chociaż myślę, że wszystko idzie dobrze, chciałem tylko sprawdzić kilka drobiazgów:

1) Nośnik RPMI, którego używam, wydaje się być lekko pomarańczowy po schłodzeniu go w temperaturze 4º, a nie różowym, który miał, gdy go otrzymałem. Wiem, że to oznaka zmiany PH, czy to normalne i w porządku?

2) Hoduję komórki w 75cm2 wentylowanych butelkach i poza zalecanymi ograniczeniami objętości w tej konkretnej kolbie, czy istnieje optymalna objętość, która jest najlepsza dla utrzymania tych komórek?

3) Utrzymuję je w gęstości od 1 do 2 x 10 (6), to jest bardziej gęste, co jest zalecane, ale wydaje się, że mają się dobrze, czy jest z tym jakiś problem?

4) Kiedy przygotowuję się do mieszania FBS z pożywką, czy mogę umieścić FBS w łaźni wodnej o temperaturze 37º w celu rozmrożenia? Dodatkowo dodaję antybiotyk Pen/Strep - czy mogę go rozmrozić w łaźni wodnej 37º?

Ja też po raz pierwszy hoduję komórki Jurkata i chociaż myślę, że wszystko idzie dobrze, chciałem tylko sprawdzić kilka drobiazgów:

1) Nośnik RPMI, którego używam, wydaje się być lekko pomarańczowy po schłodzeniu go w temperaturze 4º, a nie różowym, który miał, gdy go otrzymałem. Wiem, że to oznaka zmiany PH, czy to normalne i w porządku?

2) I am growing the cells in 75cm2 vented flasks and, aside from the reccomended volume limitations on this particular flask, is there an optimum volume that is best for maintaining these cells?

3) I am maintaining them at a density between 1 and 2 x 10(6), this is more dense that is reccomended but they seem to be doing okay, is there any problem with this?

4) When I am preparing to mix the FBS with the media, can I put the FBS in a 37º water bath to defrost? Also, I am adding Pen/Strep antibiotic-can I defrost this in 37º waterbath?

In our experience it is best to keep the cells at between 250,000 and 750,000 cells/ml. WE DO NOT USE ANTIBIOTICS. it masks POOR TECHNIQUE. And a s stated previously, the cells are best grown in TECHNE stirrer bottles. this keeps them in suspension and more importantly STOPS THEM AGGREGATING.

If you look after them properly they are one of the easiest cells to grow in large numbers.


The human body comprises more than 200 types of cells, and every one of these cell types arises from the zygote, the single cell that forms when an egg is fertilized by a sperm. Within a few days, that single cell divides over and over again until it forms a blastocysta, a hollow ball of 150 to 200 cells that give rise to every single cell type a human body needs to survive, including the umbilical cord and the placenta that nourishes the developing fetus.

Basic cell biology

Each cell type has its own size and structure appropriate for its job. Skin cells, for example, are small and compact, while nerve cells that enable you to wiggle your toes have long, branching nerve fibers called axons that conduct electrical impulses.

Cells with similar functionality form tissues, and tissues organize to form organs. Each cell has its own job within the tissue in which it is found, and all of the cells in a tissue and organ work together to make sure the organ functions properly.

Regardless of their size or structure, all human cells start with these things in common:

  • A jądro that contains DNA, the genetic library for the entire body. Different cells read and carry out different instructions from the DNA, depending on what those cells are designed to do. Your DNA determines virtually everything about your body, from the color of your eyes to your blood type and even how susceptible you are to certain diseases. Some diseases and conditions, such as color blindness, also are passed down through DNA.
  • Cytoplazma – the liquid outside the nucleus. The cytoplasm contains various components that make the materials that the cell needs to do its job.
  • The cell membrane – the surface of the cell, a complex structure that sends
    and receives signals from other cells and lets material in and out of the cell. Cells have to be able to communicate to work together in tissues and organs.

Most cells divide. Shortly before division, the DNA replicates and then the cell divides into twocórkakomórki. Each has a complete copy of the original cell’s DNA, cytoplasm and cell membrane.

About stem cells

Stem cells are the foundation of development in plants, animals and humans. In humans, there are many different types of stem cells that come from different places in the body or are formed at different times in our lives. These include embryonic stem cells that exist only at the earliest stages of development and various types of tissue-specific (lub dorosły) stem cells that appear during fetal development and remain in our bodies throughout life.
Stem cells are defined by two characteristics:

  • They can make copies of themselves, or self-renew
  • Mogą Rozróżniać, or develop, into more specialized cells

Beyond these two things, though, stem cells differ a great deal in their behaviors and capabilities.

Embryonic stem cells are pluripotent, meaning they can generate all of the body’s cell types but cannot generate support structures like the placenta and umbilical cord.

Other cells are multipotent, meaning they can generate a few different cell types, generally in a specific tissue or organ.

As the body develops and ages, the number and type of stem cells changes. Totipotent cells are no longer present after dividing into the cells that generate the placenta and umbilical cord. Pluripotent cells give rise to the specialized cells that make up the body’s organs and tissues. The stem cells that stay in your body throughout your life are tissue-specific, and there is evidence that these cells change as you age, too – your skin stem cells at age 20 won’t be exactly the same as your skin stem cells at age 80.


Obejrzyj wideo: Komórka! Najprościej o budowie komórki zwierzęcej. Mitochondrium, błona komórkowa, wakuola, jądro. (Sierpień 2022).